Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM259Q4ZIN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM259Q4ZIN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms