Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KHDC1Q4VXA5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms