Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUSP28Q4G0W2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUSP28Q4G0W2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms