Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF3Q496Y0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms