Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT71Q3SY84 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT71Q3SY84 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms