Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTLL9Q3SXZ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms