Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P3H1Q32P28 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms