Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UVSSAQ2YD98 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms