Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM71Q2Q1W2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM71Q2Q1W2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms