Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC6LQ2NKX8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC6LQ2NKX8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms