Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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