Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC96Q2M329 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms