Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ISXQ2M1V0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms