Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX7Q2KHR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX7Q2KHR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms