Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKIDA1Q1XH10 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKIDA1Q1XH10 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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