Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TXNRD1Q16881 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TXNRD1Q16881 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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