Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRNQ16849 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRNQ16849 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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