Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPP1Q16831 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPP1Q16831 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms