Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLPPQ16740 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLPPQ16740 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLPPQ16740 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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