Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIL3Q16649 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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NFIL3Q16649 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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NFIL3Q16649 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIL3Q16649 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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