Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECM1Q16610 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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