Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDB1Q16531 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDB1Q16531 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDB1Q16531 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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