Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRA6Q16445 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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