Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZIC1Q15915 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC1Q15915 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC1Q15915 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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