Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALX1Q15699 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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