Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF11Q15544 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF11Q15544 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.9 ms