Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NKX1-1Q15270 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NKX1-1Q15270 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NKX1-1Q15270 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
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