Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK1Q15118 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK1Q15118 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK1Q15118 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms