Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF6Q15052 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF6Q15052 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF6Q15052 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF6Q15052 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms