Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KARSQ15046 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KARSQ15046 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KARSQ15046 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KARSQ15046 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KARSQ15046 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KARSQ15046 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KARSQ15046 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KARSQ15046 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KARSQ15046 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KARSQ15046 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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