Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERPUD1Q15011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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