Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSPNQ14714 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms