Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX1Q14549 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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