Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1DQ13901 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1DQ13901 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1DQ13901 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1DQ13901 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1DQ13901 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C1DQ13901 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1DQ13901 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1DQ13901 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1DQ13901 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C1DQ13901 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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