Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBA3CQ13748 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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