Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA1SQ13698 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1SQ13698 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA1SQ13698 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms