Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NEUROD1Q13562 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NEUROD1Q13562 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NEUROD1Q13562 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
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