Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCIRG1Q13488 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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