Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKRN4PQ13434 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN4PQ13434 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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