Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTA1Q13424 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNTA1Q13424 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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