Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCGB2A2Q13296 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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SCGB2A2Q13296 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SCGB2A2Q13296 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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