Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME3Q13232 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NME3Q13232 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME3Q13232 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME3Q13232 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME3Q13232 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME3Q13232 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME3Q13232 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME3Q13232 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME3Q13232 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms