Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3BQ13214 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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