Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSTF3Q12996 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSTF3Q12996 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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