Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF2Q12933 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF2Q12933 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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