Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFSWAPQ12872 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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