Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 MCM7YBR202W 2538 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 TAF10YDR167W 621 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 UBC8YEL012W 657 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 REC104YHR157W 549 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 PAM18YLR008C 507 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YLR345WYLR345W 1530 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YBR225WYBR225W 2703 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YRB30YGL164C 1323 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 ALO1YML086C 1581 nt3.68□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 IRC22YEL001C 678 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 BUD16YEL029C 939 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YER076CYER076C 909 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 RPB3YIL021W 957 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YIL152WYIL152W 708 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 AIM22YJL046W 1230 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 ADD66YKL206C 804 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YPR059CYPR059C 387 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 SWH1YAR042W 3567 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 GLO3YER122C 1482 nt3.67□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YOL075CYOL075C 3885 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 USA1YML029W 2517 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 VAC17YCL063W 1272 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 FMP10YER182W 735 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 MOB2YFL034C-B 864 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YGL108CYGL108C 423 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YLR428CYLR428C 345 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 VPS71YML041C 843 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 YPR015CYPR015C 744 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 GCD1YOR260W 1737 nt3.66□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 PPQ1YPL179W 1650 nt3.65□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 RPO31YOR116C 4383 nt3.65□□□□□ -1.82
SNF8Q12483 TRM13YOL125W 1431 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YNL181WYNL181W 1224 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 KIN4YOR233W 2403 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 ROK1YGL171W 1695 nt3.65□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NPL4YBR170C 1743 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 DBP3YGL078C 1572 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 PRP11YDL043C 801 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 COS7YDL248W 1152 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 PFA5YDR459C 1125 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 COS5YJR161C 1152 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YMR147WYMR147W 672 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 ANT1YPR128C 987 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 FAT1YBR041W 2010 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NAM9YNL137C 1461 nt3.64□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 SLM5YCR024C 1479 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 RKM4YDR257C 1485 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 DIN7YDR263C 1293 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 FUR1YHR128W 651 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 MRS3YJL133W 945 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 KIP3YGL216W 2418 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 MCD4YKL165C 2760 nt3.63□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 SPO1YNL012W 1896 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 POL1YNL102W 4407 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NUS1YDL193W 1128 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 SNL1YIL016W 480 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 IRC9YJL142C 393 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 JLP1YLL057C 1239 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NCE103YNL036W 666 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 IDH2YOR136W 1110 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 MNL1YHR204W 2391 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 ERG5YMR015C 1617 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 FLO10YKR102W 3510 nt3.62□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 MYO3YKL129C 3819 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 IOC2YLR095C 2439 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 PEP7YDR323C 1548 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 CHD1YER164W 4407 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 ERV14YGL054C 417 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 TYS1YGR185C 1185 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YHB1YGR234W 1200 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 IGO2YHR132W-A 396 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 BNA1YJR025C 534 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 UTP11YKL099C 753 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 PSR1YLL010C 1284 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 IES3YLR052W 753 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 ELM1YKL048C 1923 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 GEM1YAL048C 1989 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 AIM21YIR003W 2040 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 SSU1YPL092W 1377 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YPS7YDR349C 1791 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 APP1YNL094W 1764 nt3.61□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 AVT7YIL088C 1473 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 KRE5YOR336W 4098 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 GPI10YGL142C 1851 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NOG1YPL093W 1944 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 NOP6YDL213C 678 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 PFA4YOL003C 1137 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 POC4YPL144W 447 nt3.6□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 TRK1YJL129C 3708 nt3.59□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YPR003CYPR003C 2265 nt3.59□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 CWH43YCR017C 2862 nt3.59□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 URC2YDR520C 2319 nt3.59□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 YRM1YOR172W 2361 nt3.59□□□□□ -1.83
SNF8Q12483 APL4YPR029C 2499 nt3.59□□□□□ -1.83
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