Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	ECM34	YHL043W	513 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SHE1	YBL031W	1017 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	BIK1	YCL029C	1323 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	PHO84	YML123C	1764 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SPI1	YER150W	447 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SKI8	YGL213C	1194 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	URA4	YLR420W	1095 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	PHA2	YNL316C	1005 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SIP1	YDR422C	2448 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	ROD1	YOR018W	2514 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	INO2	YDR123C	915 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YDR250C	YDR250C	276 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YGL132W	YGL132W	336 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	GTF1	YGR102C	552 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	SOD1	YJR104C	465 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	YNL143C	YNL143C	393 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY3A-G	Q12173	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	PBS2	YJL128C	2007 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RRN11	YML043C	1524 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	NOG1	YPL093W	1944 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	TRS85	YDR108W	2097 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	PCL6	YER059W	1263 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MAG1	YER142C	891 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	PAM18	YLR008C	507 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	SIW14	YNL032W	846 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RIB4	YOL143C	510 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	POL1	YNL102W	4407 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	VID28	YIL017C	2766 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	NBP2	YDR162C	711 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MMM1	YLL006W	1281 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	IBD2	YNL164C	1056 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	HUT1	YPL244C	1020 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	GAS2	YLR343W	1668 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ATG2	YNL242W	4779 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	PRE9	YGR135W	777 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	RSA3	YLR221C	663 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ATG8	YBL078C	354 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ARR1	YPR199C	885 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YBR134W	YBR134W	402 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	DEG1	YFL001W	1329 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	GSC2	YGR032W	5688 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	TAF8	YML114C	1533 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	CHK1	YBR274W	1584 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MIS1	YBR084W	2928 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	SPO74	YGL170C	1242 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	CSM2	YIL132C	642 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YLR124W	YLR124W	345 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MAP1	YLR244C	1164 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YPL073C	YPL073C	486 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.11	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.1	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	SDO1	YLR022C	753 nt		4.1	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	IMP4	YNL075W	873 nt		4.1	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.1	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MST1	YKL194C	1389 nt		4.1	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ALE1	YOR175C	1860 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	SEG1	YMR086W	2883 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	NOC2	YOR206W	2133 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	APA2	YDR530C	978 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	YBL029W	YBL029W	1131 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	MCD4	YKL165C	2760 nt		4.09	□□□□□ -1.75
TY3A-G	Q12173	ERG5	YMR015C	1617 nt		4.09	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	BUD5	YCR038C	1929 nt		4.09	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SOL4	YGR248W	768 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	SET4	YJL105W	1683 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	COQ5	YML110C	924 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	NGL3	YML118W	1518 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ALG5	YPL227C	1005 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ISA2	YPR067W	558 nt		4.08	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	ACE2	YLR131C	2313 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	MIH1	YMR036C	1665 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	VMA22	YHR060W	546 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YGK3	YOL128C	1128 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	RPO31	YOR116C	4383 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.07	□□□□□ -1.76
TY3A-G	Q12173	AKR1	YDR264C	2295 nt		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms