Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1B1Q10567 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1B1Q10567 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1B1Q10567 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP1B1Q10567 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1B1Q10567 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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