Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CGNL1Q0VF96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms